新しく開拓された沖新田の産土神として建立されました。
沖新田の開墾は、岡山藩の藩政確立に大きな役割を
果たした津田永忠が、綱政の命を受けて元禄５年（１６９２）の
正月１１日に着工しました。
その工事は急ピッチで進められ、驚くべき短期間で
潮留め築堤・疎水・検地を終え、約２，０００町歩の
広大な新田が開かれたのです。
元禄７（１６９４）年４月、沖新田全体の産土神として社を建立するため、
京都の吉田殿（当時の神祇官）に見垣近江の守を派遣し神の来臨を請願、
同年５月２３日に沖田神社の神宣が下されました。
当初は御野群（現在の岡山市福島）住吉宮に鎮座されていましたが、
元禄７年９月３日に、旧沖田神社（岡山市沖元宮地在の古宮様）
へ遷宮しました。しかし境内の土地が低いため
大風・高潮・洪水の被害を受け、拝殿にまでも水が入り込む
事があったので、宝永６年（１７０９）現在の沖田神社の地に移転し、
現在に至っています。
明治の廃藩置県後には郷社となり、大正１２年５月２５日には、県社に昇格しました。